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        “質”的飛躍:Orbitrap Astral革新修飾組學研究

        2023年09月20日 14:29:36來源:賽默飛點擊量:32706

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               翻譯后修飾(Post-translational modifications,PTMs)是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程,在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質的理化性質,進而影響蛋白質的空間構像、活性狀態、亞細胞定位、折疊及其穩定性以及蛋白互作。
         
          隨著對一些疾病逝行深入的研究后發現很多生理病理疾病的發生真實不僅僅跟蛋白本身的表達量相關,有些情況下蛋白的表達并沒有明顯的變化但是由于一些復雜的翻譯后修飾的改變從而影響了整個分子機制的改變。因此對樣本進行蛋白翻譯后修飾的研究就顯得尤為重要。蛋白修飾內容主要包括磷酸化、乙?;?、泛素化、糖基化、甲基化等。
         
          研究難點
         
          拿磷酸化修飾組學為例
         
          在眾多的PTM類型中,磷酸化修飾(Phosphorylation modification)的蛋白占到了所有蛋白質約三分之一,是普遍的修飾類型之一。會影響到細胞內信號轉導、細胞結構、細胞增殖、凋亡、轉錄、代謝過程以及調控病原微生物的適應能力等等,所以在不同細胞中,蛋白磷酸化水平會呈現不同的差異,特定位點的磷酸化程度可能從小于1%到大于90%。
         
          由于磷酸化修飾組學基本都需要經過一步富集過程,所以對于樣本量來說是一個挑戰,而在質譜整個分析過程中必須兼顧分辨率,準確度,分析深度,靈敏度,重復性等多重難題。這往往導致在樣本珍貴情況下很難在低上樣量情況下得到高通量的數據,而隨著大隊列研究的背景下,巨量樣本的分析中,能否達到足夠分析數據的同時提升分析速度,這都是目前分析面臨的難題。
         

         
          超越基因組藍圖
         
          為了更好的面對挑戰,威斯康星大學Joshua J. Coon教授利用賽默飛最新開發的Orbitrap Astral高分辨質譜儀開發的DIA工作流程就非常好的解決了這個難題。
         

         
          在2Th的窗口條件下,該流程利用了Astral分析器(非對稱無損質量分析器)的200Hz快速二級掃描功能,可以在非常短梯度的達到之前很難達到的結果。Joshua J. Coon教授分別嘗試了7分鐘,15分鐘及30分鐘的Run to run上樣時間,在7分鐘的上樣時間就能輕松鑒定到超過23,000個磷酸化位點,而在30分鐘梯度更是提升到超過29,000個磷酸化位點。而RSD值同時可以控制在10.9%,在該進一步提升上樣量到250ng時,在30分鐘上樣時間內(包含平衡,洗脫和上樣時間),可以鑒定到超過35,000磷酸化位點,達到鑒定深度,同時也非常好的體現了Orbitrap Astral高分辨質譜在高靈敏度蛋白質組學中的強大性能。而當做更多分級實驗,在240分鐘時間,更是達到驚人的接近90,000磷酸化位點數據。
         

         

         

         
          精彩會議預告
         
          集近年全球蛋白質組學領域重大突破、前沿成果、最新的儀器設備展覽及分析技術的第十二屆中國蛋白質組學大會將于 2023 年 9 月25 日-27 日在成都舉辦。
         
          在本次會議上,作為賦能科技進步企業的賽默飛攜全新一代高分辨質譜儀 Orbitrap Astral 的頭批用戶使用數據線下亮相,為市場所期待。我們趕快來一探究竟!
         
          賽默飛專題午餐會
         
          “質”的飛躍
         
          時間:9 月27 日 地點:蜀風廳 3
         
          隨著 6 月 Obitrap Astral 高分辨質譜儀驚艷面世和國內外用戶的裝機與使用,第一波相關實測數據陸續發布,這些數據無一不在證明此款儀器在組學領域的劃時代地位。Orbitrap Astral 到底是如何實現集高通量、高靈敏度和深度覆蓋于一體為蛋白組學研究帶來革命性技術突破? 賽默飛將在本次午餐會詳細揭曉國內外用戶實測一手數據。參與當天活動,更有機會把 Orbitrap Astral 同款積木帶回家!

        報告時間

        報告題目

        報告人

        12:30-13:00

        重塑可能
        賽默飛OrbitrapAstral高分辨質譜全球新真實數據展示

        軒玥博士 高級產品市場經理
        賽默飛世爾科技

        13:00-13:10

        建立蛋白質組學發現和驗證的Astral新標準

        余文祥博士 研發總監
        諾禾致源質譜事業部

        13:10-13:20

        下一代蛋白質組學基于新一代Orbitrap Astral質譜分析系統的美吉云平臺整體解決方案

        馮利興博士 質譜檢測中心 總監
        上海美吉生物醫藥科技有限公司

        13:20-13:30

        重塑可能-Orbitrap Astral在半胱氨酸修飾及血漿低豐度蛋白分析中的應用

        戴捷博士 副總經理、技術總監
        上海拜譜生物科技有限公司

         
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